The RNAs and Proteins of dsRNA Viruses

 

Edited by Peter. P. C. Mertens, Houssam Attoui and Dennis H. Bamford

Back to dsRNA virus Homepage 

[ Acc. Nos. for BTV ] Acc. Nos for AHSV ] Acc. Nos. for EHDV ] Acc. Nos. for EEV.htm ] Acc. Nos EUBV ] Acc. Nos. for PALV ] Acc. Nos. for GIV ] Acc. Nos for SCRV ] index.html ]

 

 

Accession numbers for currently available RNA sequences of bluetongue virus (BTV) serotypes 1-24

Last updated (10/04/2007):

 

p = partial sequences;   r = reference strain;  v = vaccine strain

 

Serotype

Accession numbers for individual genome segments

Segment  number (encoded protein)

 

1

(VP1(Pol))

2

(VP2)

3

(VP3(T2))

4

(VP4(CaP))

5

(NS1(TuP))

6

(VP5)

7

(VP7(T13))

8

(NS2(ViP))

9

(VP6(Hel))

10

(NS3)

 

BTV-?

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

AY028211 p

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

AB244089 p

AB244088 p

AB244087 p

E00901

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 AY137387

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

AY397620p

DQ462582p

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

A22393

AF530066   DQ289041(p)

DQ289050

(p)

DQ289049

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

NC_006015

(M28981)

 

L08628

AF397295(p)

AF397294(p)

AF397293(p)

AF397292(p)

AF397291(p)

AF397290(p)

AF397289(p)

AF397288(p)

AF397287(p)

AF397286(p)

AF397285(p)

AF397284(p)

AF397283(p)

AF397282(p)

AF397281(p)

AF397280(p)

AY028210(p)

AY493686 AY493687 AY493688 AY493689 AY462225 AY493690 AY493692 AY493684 AY493691 AY493685

 

BTV-1

 

 

AJ585122 r

X06464

X55800

M21844

AF135217 p

L42171 p

L42170 p

 AY559058 p

AY559060 p

AY559061 p 

 

 

DQ186792 r

AF529048

AF529044

DQ186807  DQ186811  DQ186816  DQ186818  DQ186820

DQ186822

AF018264 p

 

 

 

 

 

M36713

M21845

AJ586656

AJ586657

AJ586658

AJ586659

AJ586660

AJ586661

AJ586662

AJ586663

AJ586664

AJ586695

AJ783903

AJ783902

 

M63417

X53740

AF172825 AF188669 AF188670

 AY789967

AY789967

AY776331

 

X58064

 

 

D10905

AF403419

 

D00253

AF135223

AF529049

AF529052

AF529057

AF512912

AF512911

AF512910

AY677628

AY449657

 

BTV-2

 

AJ585123 r M21946

 

AF356601

DQ191275

AF481096

AF356601

DQ191274

DQ191273

DQ191272

DQ191271  DQ191270

DQ191269  DQ191268  DQ191267

AY855267

DQ191266

AY855266

DQ191265

 AY855265

DQ191264

AY855264

DQ191263

DQ191262

DQ191261  AF135218 p

AJ430062 p

AJ43006 p

AJ430060 p

AJ430059 p

AJ430058 p

AJ430057 p

DQ462580 p

DQ641923 p

 

 

DQ186793 r

L19967

S78452

AY124371

DQ186793 DQ186815  DQ186826

 

L08637

AY134477

AY129085

AY855273

AY855272

AY855271

AY855270

 

 AY138895

 

DQ017956

DQ418909p

AY741396p

 

AY855276

AY855277 AY855278 AY855279 X62283

AY189951

AY129084

AY129083

AJ586665

AJ586666

AJ586667

AJ586668

AJ586669

AJ586670

AJ586671

AJ586672

AJ586673

AJ586674

AJ586675

AJ586696

 AJ783906

AJ783905

AJ783904

AY855282

M64997

AF172826

AF346302

AF188660

AF188672 AF188674

AF469115 p

AF481095

AY079124

DQ399837

 

 

 

 

 

 

 AY138896

AY124372

AY855288

AY855287

AY855286

AY855285

 

L08668

U55799

AY124373

AF403422

AF403420

AF403421

 

 

 

AY775154

AY775153

AY775152  AF135224

AY823222

AY823221

 AY823220  AF135230

AY273207 p

AF469114

AF512920

AF512916

AF512913

AF481094

AF481093

AF481092

 

 

 

 

  EF434177           EF434175     EF434179

 

BTV-3

 

 

AJ585124 (r)

X55801

 

AF135219p

 

 AF529045

 

 

 

 

 

AJ586697

AJ586698

 

AF172827

AF188644

AF188645 AF188646

AF188647

AF188648

AF188649

AF188651 AF188652

AF188654 AF188655 AF188656 AF188657 AF188658 AF188659

AF188661

AF188663

 

 

 

 DQ289042 (p)

 

AF135225

AF529050

AF512918

AF512917

AF512906

AF512905

AY485668

    AY485669         AY485667     AY485668

 

BTV-4

 

 

 

AJ585125 r

AY839948v

AY839947

AY839946  DQ191281

 DQ191280

DQ191279

DQ191278  DQ191277 DQ191276

AY839945 AF135220 p

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

DQ186794  DQ186799  DQ186800   DQ186801  DQ186802  DQ186803  DQ186804 DQ186806  DQ186809   DQ186813  DQ186817  DQ186823  DQ186824 DQ186825

 

 

 

 AY741397 DQ017958p DQ017957p

DQ098096p

DQ098095p

DQ098093p

DQ098092p

 

AJ586676

AJ586677

AJ586678

AJ586679

AJ586680

AJ586681

AJ586682

AJ586699

AJ783909

AJ783908

 

AY841353v AF172828

AF188667 AF188668

AY841353

AY841352  AY841351

AY839949

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 AY857502

AY857501

 AY857500

AY857499

 

DQ832170 v

DQ825669

DQ825668

AF403423 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 AY857506 AY775160

AY775159

AY775158

AY775157

AY775156

AY775155

 AF135226

AF512909

AF512908

AF512907

AY691692

AY449650

AY677623

AY677622

AY677626

AY691691

AY677621

AY677627

AY677624

AY677620

AY449656

AY449655

AY449654.

AY449653

AJ783911

AJ783910

AY857505

AY857504

AY857503

  EF434176         EF434178     EF434180
   DQ825670         DQ825672 DQ825673 DQ825671  

 

BTV-5

 

 

AJ585126 (r)

 

 

 

 

 

 

AJ586700

AJ586701

AJ586702

 

 

 

 

 

 

 

 

 

BTV-6

 

 

AJ585127 (r)

 

 

 

 

 

 

 

 AJ586703

 

AF188653

AF188662

 

 

 

 

 

 

 

BTV-7

 

 

AJ585128 (r)

 

 

 

 

DQ098097p

 

 AJ586704

DQ465026(r)

 

 

 

 

 

 

 

BTV-8

 

 

AJ585129 (r)

 

 

 

 

 

 

AJ586705

AJ586706

AJ586707

 

AF188671

 

 

 

 

 

AF512924

AF512919

AY120938

 

BTV-9

 

 

AJ585130 r

DQ191285

DQ191283

DQ191282

L46686 p DQ462581 p

DQ872902 p

 

 

DQ186790  DQ186795  DQ186797  DQ186805 DQ186808

 

 

 

 

 DQ521598

DQ017962

DQ017959

AJ586683

AJ586684

AJ586685

AJ586686

AJ586687

AJ586688

AJ586708

 DQ399836p

 

 

 

 DQ289043p

 

 AY823224 v

AY823223

AY677629

 AY449651

AY438034

 

BTV-10

 

NC_006023 (X12819

 

AJ585131(r)

 

NC_006013 (M11787 )

 

NC_006014 (M22096)

 

 

 NC_006024

(Y00421)

 

L13726

 

 

 

NC_006025(Y00422)

 

DQ098098p

 

NC_006010 (D12532)

 

AJ586709

 

NC_006022 (X06463)

 

CS227863

 

X13374

 

NC_006007

(D00500 )

 

 

L08669

 

NC_006008 (D00509)

 

U55778 U55779

U55780

U55781

U55782

U55783

U55800 U55801

 

AF044372 AF044376

AF044379

AF044380 AF044381 AF044382

AF044384 AF044385

AY028210

 

BTV-11

 

L20445

 

AJ585132 (r) M17437

 

 L19968

 

L08638

 

 

 

M73715

U03284

U03285

AJ586710

 

M32102

 

 

L08670

U55784

U55785

U55786

U55787

U55796

L08631 AF044373

AF044377

AF044383 AF044386

AF044702 AF044703

AF044704

AF512923

AF512922

AF512921

 

BTV-12

 

 

AJ585133 (r)

 

 

 

 

 

 

 

AJ586711

AJ586712

 

AY263377 

AF172829

AF188673

 

 

 

 

 

AF135227

EF174159

 

BTV-13

 

L20446

AJ585134 (r)

D00153

L11741

L11874

AY855268

 

L19969

 

 L08640

AY855274

 

M97762

DQ098099p

 

X54308

AJ586713

AY855280

 

J04365

AY855283

 

AY855289

 

L08671

U55788

U55789  U55790

U55797

 

L08629

AF044374

AF044710

AF044711

AF044712

AF044713

 

BTV-14

 

 

AJ585135r

 

 

 

 

 

 

AJ586714

AJ586715

 

 

 

 

 

 

 

 

 

BTV-15

 

 

AJ585136r

AF135221p

 

 

 

 

 

DQ418908p

DQ418907p

 AJ586716

AJ586717

AJ586718

DQ465027r

 L11723

L11724

AF172830

 DQ462582

DQ399835p

DQ399834p

 

 

 

 DQ289044p

 

AF135228

 

BTV-16

 

 

AJ585137r

DQ191260

DQ191259 L46683 p

AF135222p

AF530067

 DQ186791  DQ186796   DQ186798  DQ186812  DQ186814  DQ186819  DQ186821  DQ186827

DQ186828

 

 

 

DQ017961

DQ017960

DQ098100

DQ098094

AJ586689

AJ586690

AJ586691

AJ586692

AJ586693

AJ586694

AJ586719

 

AF172831

 

 

 

 DQ289045

(p)

 

AY775163

AY775162  AF135229

AY449652

AY775164

AY775161

 

BTV-17

 

L20447

 

AJ585138 (r)

AY855269

M17438

S72158

AF017278

AF017279

DQ848152p

X55359

 

AF017280

AF017281

K02369

 

L08639

AY855275

 

X17041

X15891

 

X55359

AJ586720

AY855281

DQ080915

DQ080914

DQ080913

DQ080912

DQ080911

DQ080910 

 

X53693

AF188650

AF188664 AF188665 AF188666

Y00422

AY855284

X06463

X53693

 

 P33473

AY855290

 

 L08672

U55792 U55793 U55794 U55795

U55798

AF403418

 

L08630

AF044375 AF044378 AF044705

AF044706

AF044707

AF044708

AF044709

 

BTV-18

 

 

AJ585139 (r)

 

 

 

 

 

 

 

 AJ586721

AY643510

 

AY606206

AY643512p

 

 

 

 

AF512915

AF512914

 

 

BTV-19

 

 

AJ585140(r)

 

 

 

 

DQ098101p

 

 AJ586722

DQ465028(r)

 

 

 

 

 

 

 

BTV-20

 

 

 

 

 

 

 

X56735

 AJ586723

 

 

 

 

DQ289046

(p)

 

AF529055

 AF529056

 

BTV-21

 

 

 

AJ585142 (r)

L46684 (p)

 

 

 AB106889(p)

AB106888(p)

AB106887(p)

AF529047

AF529046

 

 

 

 

 

 AJ586724

 

 

 

 

 

 DQ289047

(p)

 

 AF529053

AF529054

AF529058

 

 

BTV-22

 

 

 

 AJ585143(r)

 

 

 

 

 

 

AJ586725

AJ586726

 

 

 

 

 

 

 

 

 

BTV-23

 

 

 

AJ585144(r)

L46685

U04200

AY643507

AY643506

AY643505

DQ238038 p

DQ238037 p

DQ238039 p

AH015346 p

 

 DQ186810

 

 

 

 

 AJ586727

AJ586728

AJ586729

AY643509

AY643508

AJ783907

 

AJ277802

AJ277802 DQ372600p

DQ372599p

AH015611p

AY643511 p

 

 

 

 DQ289048

(p)

 

 AF529051

AF529059

 

BTV-24

 

 

AJ585145 (r)

 

 

 

 

AY855264p  

AJ586730

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

(p): Data are shown for full length genome segment, except where only partial sequences are available (indicated by (p))

 

If you know of accession numbers that are missing from this table, or have new ones that you wish to add, please mail to peter.mertens@bbsrc.ac.uk

 

Table supplied  by N. Knowles and P. P. C. Mertens

 

Hit Counter

 

(The RNAs and Proteins  of dsRNA Viruses:  Edited by Peter. P. C. Mertens, Houssam Attoui and Dennis H. Bamford)